1965
成立物理研究中心
7月1日國家長期科學發展委員會(主任委員吳大猷)成立物理研究中心， 以清華物理系為主辦單位。台大物理系及中研院物理所為合辦單位。
1967
長發會改組為國家科學委員會
長發會改組為行政院國家科學委員會(主任委員吳大猷)，物理中心屬自然科學及數學組；至1982年國科會自然科學及數學組改制為自然科學發展處。
1982
自然科學及數學組改制為自然科學發展處
國科會自然科學及數學組改制為自然科學發展處。
1965
成立物理研究中心
7月1日國家長期科學發展委員會(主任委員吳大猷)成立物理研究中心， 以清華物理系為主辦單位。台大物理系及中研院物理所為合辦單位。
1967
長發會改組為國家科學委員會
長發會改組為行政院國家科學委員會(主任委員吳大猷)，物理中心屬自然科學及數學組；至1982年國科會自然科學及數學組改制為自然科學發展處。
1982
自然科學及數學組改制為自然科學發展處
國科會自然科學及數學組改制為自然科學發展處。
1984
成立中心審議委員會
為配合科技發展需要，中心組織功能調整，取消合辦單位成立「中心審議委員會」。
1987
更名為物理研究推動中心
配合科技發展需要，物理研究中心任務改變，更名為「物理研究推動中心」。
2001
首屆物理新進人員及研究推動研討會
2001年起中心每年定期主辦「物理新進人員及研究推動研討會」。
2014
更名為科技部自然司物理研究推動中心
3月3日更名為「科技部自然司物理研究推動中心」。
2020
改制為科學推展中心 物理組
因應「自然科學及永續研究推展中心」成立，改制為科學推展中心 物理組。
2021
中心審議會委員會更名為執行委員會
因應中心審議委員會調整定位，10月起更名為「執行委員會」。
2022
科技部組改為「國家科學及技術委員會」，自然科學及永續研究發展司改為「自然科學及永續研究發展處」
歷屆中心主任
| 屆數 | 中心主任 | 任期 | 大事紀要 |
| 1 |
吳大猷
(1907-2000)
|
1965 - 1966 | 1965年7月1日國家長期科學發展委員會(主任委員吳大猷)成立物理研究中心，以清華物理系為主辦單位；台大物理系及中研院物理所為合辦單位。 |
| 2 |
李怡嚴
|
1966 - 1967 | 清華物理所成立，所長兼中心主任。 |
| 3 |
王唯農
(1934-1980)
|
1967 - 1968 | 1967年長發會改組為行政院國家科學委員會(主任委員吳大猷)，物理中心屬自然科學及數學組。 |
| 4 |
王守益
|
1968 - 1969 | |
| 5 |
陳蔡鏡堂
|
1969 - 1970 | |
| 6 |
劉遠中
|
1970 - 1971 | |
| 7 |
陳蔡鏡堂
(第二次擔任)
|
1971 - 1973 | |
| 8 |
蔣亨進
|
1973 - 1975 | |
| 9 |
陳信雄
|
1975 - 1976 | |
| 10 |
陳通
|
1976 - 1978 | |
| 11 |
閻愛德
|
1978 - 1980 | |
| 12 |
顏晃徹
(1943-1995)
|
1980 - 1981 | |
| 13 |
郎棣
|
1981 - 1983 | 1982國科會自然科學及數學組改制為自然科學發展處。 |
| 14 |
陳信雄
(第二次擔任)
|
1983 - 1986 | 1984起為配合科技發展需要，中心組織功能調整，取消合辦單位， 成立中心審議委員會。 |
| 15 |
蔣亨進
(第二次擔任)
|
1986 - 1987 | |
| 16 |
張石麟
|
1987 - 1990 | 1987起為配合科技發展需要，物理研究中心任務改變， 改名為物理研究推動中心。 |
| 17 |
古煥球
|
1990 - 1993 | |
| 18 |
呂助增
|
1993 - 1996 | 1993起清華物理所所長不再兼任中心主任，中心主任由自然處處長聘任。 中心審議委員由自然處物理計畫主持人互選，任期三年。 |
| 19 |
朱國瑞
|
1996 - 1997 | |
| 20 |
齊正中
|
1997 - 1999 | 中心主任為國家理論中心(1998成立)物理組當然執行委員，理論中心物理組主任為中心當然審議委員。中華民國物理學會理事長列席中心審議委員會。 |
| 21 |
施宙聰
|
1999 - 2002 | 90年度(2001)起會計年度改為1月1日開始。 2001起中心每年定期主辦[物理新進人員及研究推動研討會] 。 |
| 22 |
古煥球
(第二次擔任)
|
2003 - 2005 | |
| 23 |
牟中瑜
|
2006 - 2007/07 | |
| 24 |
果尚志
|
2007/07 - 2010/09 | |
| 25 |
牟中瑜
(第二次擔任)
|
2010/09 - 2013/08 | |
| 26 |
林秀豪
|
2013/09 - 2016/08 | 103年3月3日更名為「科技部自然司物理研究推動中心」。 |
| 27 |
林登松
|
2016/09 - 2019/10 | |
| 28 |
張存續
|
2019/11 - 2022/02 | 改制為科學推展中心 物理組。 中心審議委員會自10月起更名為「執行委員會」。 |
| 29 |
陳柏中
|
2022/02 - | 111年7月27日科技部組改為「國家科學及技術委員會」 |